Genetic differentiation of six Peruvian alpaca populations

M. Paredes; J. Machaca; P.J. Azor; A. Alonso-Moraga; A. Membrillo; A. Muñoz‑Serrano

Genetic differentiation of six Peruvian alpaca populations

in Fibre production in South American camelids and other fibre animals

Autor:innen:

M. Paredes

M. Paredes ¹Dpto. De Genética. Universidad de Córdoba. Campus de Rabanales C-5, 14071 Córdoba, Spain; mparedes@ufro.cl

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J. Machaca

J. Machaca ²Centro de Estudios y Promoción del Desarrollo DESCOSUR. Málaga Grénet N° 678 Umacollo, Arequipa, Peru

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P.J. Azor

P.J. Azor ¹Dpto. De Genética. Universidad de Córdoba. Campus de Rabanales C-5, 14071 Córdoba, Spain; mparedes@ufro.cl

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A. Alonso-Moraga

A. Alonso-Moraga ¹Dpto. De Genética. Universidad de Córdoba. Campus de Rabanales C-5, 14071 Córdoba, Spain; mparedes@ufro.cl

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A. Membrillo

A. Membrillo ¹Dpto. De Genética. Universidad de Córdoba. Campus de Rabanales C-5, 14071 Córdoba, Spain; mparedes@ufro.cl

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, und

A. Muñoz‑Serrano

A. Muñoz‑Serrano ¹Dpto. De Genética. Universidad de Córdoba. Campus de Rabanales C-5, 14071 Córdoba, Spain; mparedes@ufro.cl

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Art:: Kapitel

Seiten:: 161–166

DOI:: https://doi.org/10.3920/9789086867271_022

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We analysed 227 individuals belonging to six populations of alpaca from the high-Andean zones in Peru, where livestock production is based on the breeding of domestic South American camelids (alpacas and llamas), basically alpacas from the Huacaya breed. Twenty microsatellite markers were analysed and genetic variability and genetic differentiation parameters were estimated. Expected heterozygosity (He) ranged from 0.660 in population 5 to 0.717 in population 3. Observed heterozygosity (Ho) oscillated from 0.552 in population 2 to 0.637 in population 4. Average number of alleles per locus in each population ranged from 5.65 in population 2 to 9.2 in population 1. In order to analyse the genetic structure and genetic differentiation we estimated the Wright’s F-statistics. F_ST values between populations ranged from 0.00466 between 4 and 6 populations pair and 0.4998 between 4 and 5 populations pairs. Average FST value between populations was 0.0299 (0.0212 - 0.0408). Average F_IT and F_IS values were 0.1742 (0.0789 - 0.2968) and 0.14874 (0.0551 - 0.2664) respectively. Estimated number of migrants per generation between populations was very high as we detected a scarce genetic differentiation between them. The high level of observed homozygosity may be due to inbreeding.

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Fibre production in South American camelids and other fibre animals

ISBN:: 9789086867271

Verleger:: Wageningen Academic

Print-Publikationsdatum:: 30 Oct 2011

Fachgebiete
- Biowissenschaften
  - Allgemein
  - Tiere und Veterinärmedizin

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